影响药物疗效的常见因素有如下几种。
1、动物的种属
动物的种属不同，它们的生理结构和代谢机能就存在着差别，对药物的反应也不同。例如，牛、羊、鹿等反刍动物对麻醉药物水合氯醛比较敏感，而猪对麻醉药物水合氯醛则有一定的耐受力，牛对汞制剂比较敏感，复胃动物不应过多使用抗生素，以免干扰其胃内正常的消化活动。
2、合并用药
两种药物同时使用称为合并用药。如果这两种药物的药理作用相似，合并使用时常可增加药效，起到协同治疗的作用。这就是说，这样的合并用药能提高药物的效能，还可以减少药物的用量。例如，在使用磺胺类药物时，同时使用磺胺增效剂，疗效一般可提高几倍。
3、重复用药
某些药物必须用了再用，在规定的时间内重复给药，并持续用药至若干日后才能达到治病的目的。各种抗生素与磺胺类药物，就应该这样使用，理由是可以保持血液中的药物浓度于一定水平。因为每一次输入体内的药物不可能长久保留在血液里，时间一长，药物就会排泄出体外。故只有重复补充药物，才能达到治疗的目的。重复用药通常是1日用药2-3次，连续使用数日，当然，也不宜长期使用，以防体内药物积蓄，产生不良后果。
4、配伍禁忌
不同的药物在配伍不当时，会发上沉淀、结块、变色等异常现象，或生成有毒物质，失去实际意义，这叫配伍禁忌。用药人员必须熟悉各种药物的性状和性能，合用调配时要防止出现配伍禁忌。