消毒，一直是大家认为的最好的控制疾病的方法，且喷雾消毒是控制环境消毒的最好方法，既能控制舍内尘埃的飞扬，也能控制舍内病原体及有毒气体的释放，但是消毒也不是完全没有弊端，尤其是能提高舍内湿度，不利于控制法氏囊病和球虫病的发生。所以在法氏囊病和球虫病的高发季节则减少喷雾消毒的次数，适量结合饮水消毒，以提高消毒效果。
有机酸，能够净化饮水，防止水中生物膜形成，调节消化系统pH值，促进饲料生物利用率，杀灭胃肠道内致病菌等等。在市面上已经出现食用和消毒剂两大类的酸制剂，在喷雾或饮用中也都有类似的效果，所以在夏秋季节适量给鸡群饮用有机酸制剂，除了可以改善舍内环境，还可以有效地降低胃肠道疾病及球虫病的发生。