近年来仔猪流行性腹泻呈现出新的变化，以往猪场在爆发流行性腹泻以后，通常有很长时间的保护，不容易复发;然而如今，爆发过流行性腹泻的猪场，经常会反复发生，甚至一年重复发生2-4次，这些反复发生流行性腹泻的农场通常都有以下共同特点：
第一、蓝耳病不稳定;
第二、猪场蓝耳病毒毒株较多;
第三、使用过强毒株的蓝耳活疫苗;
第四、每年蓝耳疫苗普免次数较多;
第五、返饲效果一般。
总结这些特点可以发现，蓝耳病毒不稳定，流行毒株多，并且使用强毒株蓝耳苗进行频繁免疫，这些都可能导致母猪免疫抑制，免疫反应较差，导致母猪奶水中的母源抗体含量有高有低，母源抗体低的仔猪保护力较差，当接触到环境中的PED野毒时，就会发生腹泻。
补充参考：2011-2012年对广西11地市多家猪场共232份仔猪腹泻临床样本的流行病学调查发现，猪流行性腹泻病毒(PEDV)、猪轮状病毒(PoRV)的阳性率分别为37.50%和0.03%，猪传染性胃肠炎病毒(TGEV)为阴性。提示2011年至今致使广西仔猪腹泻的病毒主要是PEDV。
大部分广西流行毒株与2011年以来我国广东、福建、江苏、江西四省流行毒株的亲缘关系较近，与2007年以来泰国、韩国的流行毒株亲缘关系也非常密切，但与我国2006年前分离获得的北方毒株、经典疫苗株、韩国疫苗株亲缘关系较远。
