根据发病情况有所不同，一般采用针对病原微生物的药物，搭配祛痰药和多维进行治疗。如果有新城疫或传染性支气管炎等病毒感染，可以使用相应疫苗进行紧急接种。
在秋冬季节预防呼吸道疾病可以从以下几个方面着手：
1、缩小鸡舍内的温差
在实际生产中可以根据鸡群的表现判断出温度是否过低，当大部分鸡站立、扎堆并且出现采食量下降时说明温度已经太低，需要提高舍温。不过鸡群经过锻炼可以逐渐适应更低的温度。值得注意的是，如果鸡舍内的温度出现剧烈变化，鸡群则很容易发生呼吸道疾病。一般来说，在秋冬季节，24小时之内鸡舍内的体感温度不应该超过5℃。体感温度是指鸡感受到的温度，与风速有关，在有风的情况下，鸡群的体感温度会低于温度计显示的温度。进入秋季以后，鸡场的管理人员应该每天关注天气预报，对鸡舍的通风和取暖措施做出调整，将鸡舍每天的平均温度逐渐降低到场内规定的最低值，同时尽量缩小鸡舍内的温差。
2、保障鸡舍内的空气质量
一般来说，鸡舍内的空气在8分钟内更换一次可以保证良好的空气质量。对于采取自然通风，又无法测定空气质量的鸡舍，只能依靠人的感受来判断鸡舍内的空气质量。当空气质量较差时，人长时间待在鸡舍里会有呼吸不畅，嗓子痒，眼睛剌痛等感觉。这时就需要增加通风量，随之下调鸡舍的目标温度(缓慢下调，注意温差)，当鸡舍的温度已经降到能接受的下限时，应该采用供暖措施。此外，鸡舍内的湿度和空气质量有很大关系，秋冬季节鸡舍内的湿度保持在50％～60％之间最合适，湿度太低的鸡舍容易泛起灰尘，而湿度太大又会助涨鸡舍内氨气的浓度。
3、做好呼吸道疾病的免疫工
传染性支气管炎，传染性喉气管炎等病毒性疾病主要依靠免疫来进行预防。免疫工作包括制定一个合理的免疫程序，选择合适的毒株和优质的疫苗，按照说明进行保存和运输，严格按照规程进行免疫操作等。
4、加强鸡舍内的卫生消毒工作
通过消毒可以减少鸡舍内病原微生物的数量。具体措施包括使用消毒药拖地，脚踏消毒盆，喷雾消毒，经常擦洗喂料与饮水设备等。需要注意的是在鸡舍内使用喷雾消毒会降低舍内温度，冬季应慎用。
尽管治疗在一定程度上能够解决问题，但是鸡群一旦发病，即使治疗成功也会给生产造成一定的损失。更糟糕的是，某些鸡场整个冬季鸡群呼吸道问题不断，几乎所有种类的药物都使用过，最后感染鸡群的病原微生物产生了严重的耐药性。因此，想解决秋冬季节的呼吸道问题，根本方法还是预防，其成本要远低于治疗。
