母猪子宫内人工授精(IUI),又称深度人工授精，是利用特制的输精导管将精子驻留于距子宫颈15～500px子宫腔内的一种输精技术。猪子宫内人工授精技术具有传统人工授精技术(子宫颈处)几乎所有优点，另外大幅度降低了每次输精精液量和精子浓度，从而减少种公猪引进及饲养费用开支。该技术在欧美养猪大国已着手推广，但在国内使用的范围还不是很广。
该技术具有几个优点：
1、减少母猪情期内的输精剂量及提高母猪配种受胎率。猪的子宫非常长，输精后精子在子宫游动时往往在中途能量就消耗尽了，死在中途，真正到达输精部位的有效精子较少。而用深部输精法，精子在运动过程中损失的少，有效精子到达受精部位(输卵管膨大部)的多了，将大大提高了母猪配种受胎率。常规人工授精输精量为80-100mL/次，而子宫内输精只要50-85mL/次，大大提高了优良公猪的利用效率。
2、减少输精时间。常规输精需要5min/次，而子宫内输精只需要2min/次，较常规输精节省一半以上的时间。
3、减少精液回流现象。进行传统子宫颈人工输精时，精液回流是经常发生的事情，回流量占输精总量1%～56%，而深部输精只要正确的将输精管插进子宫肉，就不会发生回流现象。
4、加快选育进程。如果公猪一次的射精量能满足更多的母猪授精需要，则猪种选育强度就得以加强。
5、可以帮助鉴定发情。一般发情期内的母猪有18～24小时其子宫颈处于完全张开状态，是实施授精的最佳时间段。一般在出现静立现象后12小时实施第一次输精，12小时后进行第二次输精。Isabelle Besnard(2002)称如果内导管不能导入，则表明母猪还没有或者已经过了发情期，借此可以帮助正确判断母猪的发情而避免误配。
但也存在一些缺点：
1、该技术应用成本都较高。IUI输精管的价格是普通人工授精输精管价格的3倍，所有母猪不能使用统一规格的精液和授精方式，于是就增加了精液生产、包装和输精时的工作量。
2、技术较难掌握，配种人员授精效果个体差异非常明显，母猪繁殖性能不稳定。
3、极易损伤母猪子宫。由于导管难以通过青年母猪的子宫颈，若强行插入可能导致损伤，所以该技术只适合对经产母猪配种，不能用于初产母猪。而且配种人员授精效果的个体差异非常明显，导致繁殖性能不稳定。
4、基因池缩小的问题。减少公猪饲养总量虽然可以增加效益和均匀度，但从遗传学的角度看，缩小“基因池”存在一些危险。较少的公猪可能潜在地增加了近亲繁殖。而且通过限制基因的多样性可能无意地选择了一些阴性特性。
