羊场消毒的目的是消灭传染源散播于外界环境中的病原微生物，切断传播途径，阻止疫病继续蔓延。羊场应建立切实可行的消毒制度，定期对羊舍地面土壤、粪便、污水、皮毛等进行消毒。
一、羊舍和羊舍的进出口应设消毒池，池深10～20厘米，内填锯末等，定期加入30至50％的火碱溶液或10％的正点溶液。
二、羊舍及运动场内的粪便要每天定时清扫，保持羊舍及运动场清洁、干燥、卫生。地面每10～20天用火碱溶液、生石灰或正溶液喷洒消毒1次或其它消毒药也可以。
三、羊舍墙壁、羊栏等也要每7～15天用15％的石灰乳或20％的草木灰水进行粉刷或喷洒消毒。饲槽和水槽等用具每5～10天用1％的正点溶液消毒1次。
四、对病羊粪便不可随便堆放，要进行堆积泥封发酵或投入沼气池中进行发酵，以杀死病原菌和寄生虫虫卵，从而达到消毒的目的。