合格种蛋产蛋率是衡量蛋种鸡养殖企业饲养效率和盈利能力的最重要生产指标之一。其受两个指标共同影响，一是种鸡产蛋率，二为种蛋合格率，二者乘积即为合格种蛋产蛋率。产蛋率由鸡的品种、饲料营养水平、疾病防控措施、饲养管理技术、环境条件等主要因素决定；而种蛋合格率除受品种与日龄、疾病、应激、营养因素影响外，还与种蛋收集与运输环节相关。为了获得较高的合格种蛋产蛋率指标，提高蛋种鸡养殖企业的经济效益，要在保障鸡群健康，确保高产、稳产的前提下，最大限度提高鸡群的种蛋合格率。
一、影响合格种蛋产蛋率的因素
1、品种与日龄
品种与日龄对种蛋合格率的影响反映在蛋重大小及蛋壳质量的好坏。蛋重随着鸡群日龄的增大而增大，而只有符合55-68克的种蛋才最为适宜留做种用。因此，需通过饲料营养提高蛋种鸡180日龄以前的蛋重，控制55周龄以后蛋重，以提高种蛋的合格率；蛋壳质量随日龄的增大而发生变化，一般产蛋鸡群36周龄后蛋壳质量逐渐变差。但蛋壳的形成十分复杂, 诸多因素如母鸡的品种、年龄、母性行为、营养、疾病、药物、环境条件、管理、设备等均会对蛋壳品质造成影响，虽然我国对蛋壳质量的研究已持续十几年, 但劣质蛋壳仍然是造成蛋鸡业经济损失的一个重要原因。
2、疾病因素
对鸡群合格种蛋产蛋率影响较大的疾病主要为传染性支气管炎（IB）和产蛋期的坏死性肠炎，两者在发病的不同时期都会造成产蛋率的大幅下降。
鸡群感染传染性支气管炎病毒（IB）后，不会导致明显死亡增加，其通常是一过性感染，病程较短，痊愈后鸡群快速恢复精神状态，但IB病毒已对鸡只输卵管造成损伤。尤其在育成期间感染的鸡群，在产蛋期形成为不产蛋的“水裆鸡”（俗称大肚子鸡），造成养殖企业生产成本显著增加。在产蛋期感染本病后也可造成鸡只终生生产软壳蛋、无壳蛋，丧失饲养价值；鸡群感染坏死性肠炎后，将导致鸡只消化系统不可逆的损伤，影响营养物质的吸收，进而导致生殖系统萎缩、失去产蛋能力，直至死亡。
3、应激因素
饲养管理过程中，鸡群因采食过多或过少、免疫应激、人工输精应激、舍内环境控制等管理不当造成个别鸡只体质下降而处于亚健康状态。而饲养亚健康鸡只，不但增加鸡群饲养的直接成本，亦会降低合格种蛋产蛋率。因此，日常管理过程中，对于亚健康鸡只要及时挑选后单笼饲养，待其恢复一段时间正常产蛋后再进行人工输精。
4、种蛋收集与运输因素
种蛋的收集与运输环节处理不当，亦会导致大量合格种蛋的人为破损，间接降低种蛋合格率。
二、提高合格种蛋产蛋率的措施
1、 营养调控确保蛋重适宜
一般蛋种鸡进行人工输精和种蛋收集的周龄为25-63周龄。在25周龄前，蛋重普遍较小，而低于55克种蛋不宜留作种用，因此，在高峰期要饲喂高能量、高蛋白日粮，以提高前期蛋重。经统计，55-63周龄的平均蛋重为62.5克，其中72克以上约占2%，68-72克约为11.4%，57-68克约为77.5%，57克以下约为8.99%，因此需根据蛋重的变化，调整鸡群的日耗料，做到定量饲喂，防止鸡采食过多而造成蛋重过大。
2、预防疾病提高鸡群健康
做好疾病防控工作，通过建立完善的生物安全体系，将病原挡在场区之外，避免鸡群感染疾病。尤其在育雏育成期，鸡群对IB病毒的抵抗力较弱，更需要通过环境控制与免疫杜绝疾病的发生。一般而言，鸡群产蛋后期是坏死性肠炎的高发期，此期间鸡群由于前期产蛋的大量消耗，致使体质减弱，个别鸡只相继感染疾病，变为亚健康状态甚至死亡。因此，需日常做好舍内外环境的隔离与消毒，饲养全程做好鸡群疾病防控工作。
3、减少应激提高鸡群体质
亚健康鸡只的产生主要由日常管理应激造成，应根据不同应激因素采取不同措施。
①、人工输精可使种鸡易感输卵管炎，继而导致肛门括约肌收缩无力，输卵管在产蛋后滞留体外，容易使鸡脱肛。解决的办法是在人工输精时保持输精器具干净卫生，对已有脱肛症状的鸡只及时挑出、单笼饲养，并涂抹药物进行治疗。
②、为了降低日常管理应激，首先要规范日常管理操作流程与标准，建立喂料流程，拣蛋流程，人工输精操作流程，卫生清扫流程，带鸡消毒程序等，使鸡群形成良好的条件反射减少应激的发生。
③、对于亚健康鸡只管理，要及早挑出，单笼饲养，对症状治疗，尽早淘汰无饲养价值鸡只，减少不必要的成本支出。
④、另外，要关注外界天气变化，做好舍内温度、湿度的调控，防止鸡只热应激与冷应激的发生。对于近期可能出现的气候变化，建立温度预警机制，制定月、周、日通风工作计划。尤其是在冬春、秋冬交替期间，防止由于外界温度的突变而造成的冷应激，确保舍内温度适宜、均匀、稳定，进而保证鸡群产蛋稳定。
4、专用周转车降低种蛋破损率
为了提高员工工作效率，降低种蛋周转成本，减少破损率，鸡舍产出的种蛋直接放入孵化盘，使用专用周转车运输种蛋，减少了孵化厅码蛋环节，与孵化车对接，装卸方便且大大降低员工劳动强度，同时，解决了长途运输破损率高的难题，将种蛋破损率控制在0.2%以内。
