导致奶牛乳蛋白低主要有以下几个原因：
1、品种：相对来讲乳蛋白受遗传因素的影响较大，如澳牛乳蛋白相对较高，而中国荷斯坦牛的乳蛋白较低。
2、干物质采食量低：奶牛干物质采食量上不去，对整个乳成分都会影响，包括乳蛋白，乳糖，干物质等指标。
3、粗料品质差：粗料品质差会导致采食量降低，瘤胃微生物的合成也会受到影响。
4、日粮蛋白品质差：日粮蛋白品质差，也就是进入小肠的代谢蛋白的品质比较差，影响氨基酸的吸收和利用，导致低乳蛋白。
5、日粮蛋白低:日粮蛋白过低，奶牛蛋白缺乏，导致低乳蛋白
6、瘤胃功能差/瘤胃能氮平衡差：精料过多或粗料品质差，造成瘤胃酸中毒，将会影响瘤胃微生物蛋白产量。一般产奶牛瘤胃微生物蛋白的合成量占到奶牛所需要蛋白的50～60%，并且瘤胃微生物蛋白中必需氨基酸（赖氨酸/蛋氨酸）水平高（2.6%/7.9%）对奶牛来讲是非常优质的蛋白源。日粮中非纤维性碳水化合物/淀粉过低，也会影响到瘤胃微生物蛋白合成量降低。
7、代谢蛋白中必需氨基酸（赖氨酸/蛋氨酸）水平低或不平衡：在秸秆等粗料条件下，奶牛可利用蛋白中蛋氨酸和赖氨酸的水平很低（1.7%～1.8%/5.6%～5.8），相反在以优质全贮青贮和苜蓿草日粮条件下，蛋氨酸/赖氨酸水平分别可以达到1.9%～2.0%,赖氨酸水平可以达到6.3%～6.5%。很明显在这两种饲养水平下，可利用蛋白中限制型氨基酸的含量差别极大。这也是规模化牧场牛奶成分普遍较高的重要原因之一。
8、乳腺疾病（隐性乳腺炎）：乳腺的健康对乳品质影响极大。在隐性乳腺炎存在的情况下，乳腺的各项功能都会受到影响，包括乳蛋白合成的功能。
9、日粮脂肪的添加：脂肪对瘤胃微生物生长有抑制，会影响瘤胃微生物蛋白的合成，如大量的棉籽的使用会导致乳蛋白降低。
10、夏季炎热时，奶牛会产生热应激，奶牛的采食量降低，尤其是粗饲料的采食量降低，瘤胃功能下降，微生物蛋白合成量下降，导致乳蛋白低
11、大量饲喂苜蓿颗粒等过短的粗饲料，奶牛反刍不好，造成慢性瘤胃算中毒。
解决乳蛋白过低的方法：
1、利用基因改善：根据奶牛乳蛋白低的特点，选择乳蛋白较高的公牛的冻精来改善乳蛋白是最经济有效的途径之一。
2、高质量的粗饲料：高质量的全贮青贮不仅能改善乳成分，预防瘤胃酸中毒（不需要喂大量的精饲料）而且还能显著提高产量（1～3kg/天/头）和降低饲养成本。苜蓿干草是奶牛最好的粗饲料，高产奶牛每天3kg苜蓿干草，不仅改善瘤胃健康还能提高乳成份和产量。
3、提高饲料中蛋白水平和品质：饲料蛋白占到奶牛所需要蛋白的40%～50%，饲料蛋白品质过差，虽然蛋白绝对量高，但是蛋白的消化吸收率低，影响乳蛋白的合成。
4、改善脂肪对瘤胃微生物的影响：尽量使用过瘤胃脂肪，如果补充脂肪，可以适当添加奶牛专用抗氧化剂。
5、使用过瘤胃必需氨基酸：奶牛可利用蛋白中赖氨酸的水平通过日粮调整相对容易满足，但蛋氨酸和难满足，所以通过调整配方和利用过瘤胃蛋氨酸以提高可利用蛋白中氨基酸的平衡，从而提高蛋白的利用率。
6、隐性乳腺炎的治疗：预防隐性乳腺炎可以提高乳成分和产量。乳腺健康可以用体细胞的数量来评价或通过加州乳腺炎检测方法来检测。
7、提高瘤胃微生物蛋白产量：注意能氮平衡，添加可以促进瘤胃微生物蛋白合成的添加剂，以提高可利用蛋白的品质，从而提高氨基酸利用率，改善乳蛋白。
8、夏季注意奶牛遮荫等防暑降温措施。
9、足够的长粗饲料（>3kg/天）。
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