臭蛋的危害不仅污染环境影响孵化率，而且危害雏鸡健康。 其危害机理主要是：臭蛋内容物含大量绿脓杆菌，臭蛋一旦爆裂,其内侵入正常种蛋内部繁殖，引起这些正常发育种蛋胚胎死亡、发臭，变成另一臭蛋污染源，再污染其它种蛋，形成恶性循环。另外，臭蛋内高含有浓度的硫化氢气体，散发在孵化室内，影响胚胎的呼吸代谢。如果室内硫化氢达到较高浓度， 将造成胚胎窒息死亡，从而影响出雏率。
孵化中预防臭蛋的措施：
1.为防止种蛋被污染，应做到及时捡蛋，最好每半到一小时捡蛋一次。
2.严格挑选种蛋。脏蛋、破蛋、裂纹蛋、薄壳蛋不能入孵， 禁止用湿抹布擦拭种蛋。
3.搞好种蛋消毒。种蛋从鸡舍内捡出后，立即用高锰酸钾、 福尔马林熏蒸 20分钟后送入蛋库，上蛋后在孵化室内再熏蒸20分钟。
4.照蛋，落盘时应及时发师并除去臭蛋、裂纹蛋。
5.搞好孵化用具及孵化室的清洗消毒。孵化用具如蛋盘， 出雏盘要用药液浸泡，冲掉蛋皮、蛋液和胎粪、粘液等污垢。
