玉米酒糟与玉米一样，其氨基酸不平衡，且利用率略低于玉米。由于玉米酒糟是一种副产品，它的养分含量受玉米本身的品质和加工工艺的影响而变异很大，玉米酒糟的颜色变化从暗褐色到金黄色气味则从糊焦味或者烟熏味到甜香味。玉米酒糟的颜色和气味与其营养成分密切相关，深颜色的玉米酒糟营养价值要低于浅颜色的玉米酒糟，并且发现深颜色的玉米酒糟通常伴有糊焦味或者烟熏味，会影响饲料的适口性,这可能是由于在干燥过程中过度加热引起的。另外,玉米酒糟颜色越浅,赖氨酸含量越高，ADF和ADIN浓度越低,其营养价值越大。玉米酒糟对猪造成危害的主要是霉菌毒素中的玉米赤霉烯酮和呕吐毒素。日粮中两种霉菌毒素的最大允许量不超过1mg/kg,过多摄入大量霉菌毒素可引起中毒等现象，特别是对于农村信息网版权所有母猪。发酵过程并不能对霉菌毒素产生破坏作用，反而使其和赖氨酸等养分一样,浓度提高2倍。所以,原料玉米中霉菌毒素的含量,直接影响玉米酒糟饲喂动物的生产效果。
