利用微生物学原理进行鱼病诊断，无疑是比较全面、深入、细致、准确的科学方法，但必须具有微生物学知识、实验操作技能和比较完善的实验设备。研究内容包括病原体的分离、纯培养，病原体的生理、生化试验，病原体的药物敏感试验和疾病防治试验等。这样做工作量大，花费多，耗时长。鉴于目前我国大多数养鱼者尚无条件完全采用，现从生产实际出发，介绍快速观察与诊断鱼病的技巧，分述如下。1.观察病鱼的共同特征各种鱼病都有其特殊性，病鱼都有其共同特征，主要表现在鱼的行为和体色上。患病的鱼比较普遍的症状是：早晨巡塘时，可以发现病鱼离群，在塘边浮于水面缓缓独游；亦有的病鱼在塘中拥挤成团或浮在水面游动，显得焦躁不安或间断狂游；有的病鱼头部朝上或朝下，垂直立于水中，木然不动或上下急窜。病鱼体色一般都发黑，亦有的整体色白或部分体色发白。如果发现上述症状，表明该鱼可能已患病，应进行以下诊断。2.肉眼诊断对于大型寄生虫病的诊断可采用此法，当前常见的病毒性疾病和细菌性疾病一般亦依据外表症状进行肉眼诊断。首先确定鱼的患病部位，根据明显症状和病原作出诊断，即用肉眼观察是皮肤有病，还是鳃、肠道患病。有很多病变出现在皮肤、鳃、肠道上，用肉眼就可以看到明显的症状或寄生虫，当即可以作出诊断。例如，体表局部或大部充血、发炎，鳞片脱落，则为赤皮病；嘴圈发白，为白头白嘴病；当年草鱼种肌肉出血，则为传染性出血病；体色发黑，鳃丝腐烂发白，尖端软骨外露，鳃上污泥、粘液多，则为细菌性烂鳃病；体表有许多形状、大小不规则的隆起包囊，则为粘孢子虫病；肉眼看到在鱼体表有锚头鱼蚤寄生，则为锚头鱼蚤病；肉眼看到在鳃丝上挂着蝇蛆状的小虫，则为中华鱼蚤病；肉眼看到在鱼体表丛生着很多旧棉絮状的丝状体，则为水霉病。在夏花阶段，若鱼种发生死亡，并未发现明显症状，仅病鱼离群缓慢独游，体色发黑，鳃丝粘液增多，颜色与正常鳃丝有所不同，有的呈鲜红色，有的呈淡红色，基本上就可以诊断为原生动物鳃病。鳃霉病可以根据症状、季节、水质、鱼的种类、鱼体大小进行诊断。若鳃末端腐烂，有粘液、污泥，即为细菌性鳃病；鳃片苍白，略带血红色小点，即为鳃霉病；鳃片粘液较多，即为隐鞭虫或斜管虫、指环虫等寄生引起；鳃部肿大，鳃盖张开，多为中华鱼蚤或双身虫、粘孢子虫等寄生引起。鱼的体表局部出血、发炎、脓肿，即为疖疱病；鲢鱼、鳙鱼尾柄及腹部两侧形成椭圆形红斑，即为打印病；鱼的皮肤、鳍条、鳃瓣上布满白色小点囊包，即为小瓜虫寄生引起；鱼眼混浊，有白色内障，严重时水晶体脱落，即为复口吸虫病；鳃盖、鳍条发红，肌肉呈斑点状出血，即为病毒性出血病；鱼肛门红肿，肠壁充血发炎，有淡黄色粘液，严重时肠壁呈紫红色，即为细菌性肠炎病；鲢鱼、鳙鱼的吻端、鳃盖、眼眶及各个鳍条、鳍基充血，严重时肌肉软腐甚至穿穴，肛门红肿、突出，腹腔血水外流，解剖可见肝脏水肿，有出血点，胆囊肿大，甚至肝脏及肾脏全部坏死，肠道排空有出血点和气泡，根据这些综合症状，可诊断为鲢鱼、鳙鱼溶血性腹水病。根据以上肉眼检查结果，可以迅速诊断鱼病，及时对症下药，尽量减少经济损失。3.显微镜诊断显微镜检查(简称镜检)是在肉眼检查的基础上进行微观检查的技术，可以从重点检查、必须检查的部位开始。肉眼检查遇到疑难症状时，应按体表、鳃、肠、眼等部位顺序进行检查。镜检常用于原生动物等小型寄生虫疾病的确诊和其他疾病的辅助诊断。一般采集3～5尾病鱼或刚死尚未腐烂变质的病鱼作为检查材料。镜检部位按下列次序进行。
①体表。寄生在体表的小型寄生虫种类很多，有车轮虫、斜管虫、口丝虫、钩介幼虫等。采用低倍显微镜(50～100倍)直接观察病鱼体表，或刮下体表粘液放在载玻片上镜检，便能观察清楚。②鳃。寄生在鳃部的小型寄生虫有车轮虫、隐鞭虫、斜管虫、口丝虫、舌杯虫、指环虫、钩介幼虫等。用镊子取出病鱼的一小部分鳃丝与粘液(加1～2滴无菌水拌匀)，置于载玻片上即可进行镜检。③肠道。若检查青鱼是否患了球虫病，须经无菌操作解剖病鱼，然后用镊子取出一点前肠肠壁粘液放在载玻片上(加1～2滴无菌水拌匀)进行镜检。若找到艾美耳球虫即可作出诊断。④眼。将鱼的整个眼球或水晶体压在载玻片上镜检，若在水晶体或玻璃体内找到复口吸虫囊蚴，则为复口吸虫病。⑤脑。若鱼患疯狂病，打开脑腔，通过镜检，在脑、拟淋巴液、脊髓、脑神经等处找到粘孢子虫的营养体，将包囊压碎可以看到孢子，即可诊断。4.综合分析作出最后确诊鱼死亡有时不完全是病原体感染引起，可能是农药或污水中毒，或者是患营养缺乏症等，这就要根据症状进行综合分析，最后确诊。鱼患病经常是几种病症并发，应找出主次原因，顺次进行治疗。