在高密度养殖的环境中，天然饵料很少，主要依靠人工饵料。但人工饵料的配制往往营养并不能满足鱼类的营养需要。可能某些营养不足而有些营养过剩，喂食这种营养不平衡的饲料不仅会影响鱼类生长，使鱼类体质下降，严重时还会引起鱼病。所以应特别引起注意。下面就饲料中常见的营养问题分述如下。
一．蛋白质缺乏或过剩
蛋白质是鱼类生长和维持生命活动必需的营养素，不但是构成鱼体各组织的重要组成成份，而且还与酶和激素的组成和生理机能密切相关。
鱼类从食物中摄取蛋白质，在消化道中水解成氨基酸，鱼类吸收氨基酸用于合成鱼体蛋白质或分解产生热能，所以蛋白质不但是鱼类合成蛋白质过程中的氨基酸供给源，而且还是能量来源。
鱼类对蛋白质的需求量比畜禽高，如稚鸡饲料中的蛋白质含量为18%时即可满足正常生长发育的需要，仔猪为15%，牛为13%；而幼鱼对饲料中的蛋白质需要量一般为40~48%，成鱼为28~33%。
饲喂蛋白质含量低或蛋白质的质量差（氨基酸组成不合理）的饲料，将直接影响到鱼的生长速度和健康状况。当饲料中的蛋白质含量低于需要量时，鱼类生长缓慢，蛋白质含量过低时，鱼的增重停止甚至体重减轻，体质下降，抗病能力降低。另外蛋白质的组成不合理，鱼类所需的（不能自身合成的）十种必需氨基酸摄取量不足时，鱼的生长速度下降。
如果饲料中的蛋白质含量超过需要量，鱼体蛋白质的积蓄量几乎不变，体重增加并不与饲料中蛋白质含量成正比。这不但造成了蛋白质的浪费。其蛋白质的代谢产物还污染水质。鱼类有优先利用氨基酸提供能量的能力，其氨基酸的代谢产物主要以氨的形式排泄到水中，过量的蛋白质增加了氨的排泄量。据测定在高密度养殖的情况下，1公斤鲤鱼一天排泄氨氮1500毫克、1公斤罗氏沼虾一天排泄氨氮2100毫克；1公斤甲壳类每天排出的代谢废物氨为1000毫克；水中氨的积累败坏了水质，直接影响了池塘的生产力。
二．碳水化合物含量超标
饲料中的可消化的碳水化合物不但可以提供热量，而且还参与机体的许多代谢活动，并作为合成非必需氨基酸和核酸的前体而被鱼类利用。饲料中不能消化的纤维素可改善饲料的适口性和延长食物通过消化道的时间，促进肠道吸收。饲料中含有适量的碳水化合物可提高蛋白质的利用率。
鱼类对碳水化合物的消化吸收率都不高。且饲料中的适宜含量也比畜禽低。一般认为杂食性鱼类能很好地利用饲料的中碳水化合物，而肉食性鱼类则很差。据报导，鲤鱼成鱼饲料中可消化碳水化合物的适宜含量为38~40%，草鱼种为35~40%，团头鲂夏花为25~30%，青鱼成鱼为9.5~18.6%，鲮鱼为24~26%。饲料中不能消化的纤维素的适宜含量鲤鱼为12~14%，草鱼为15%以下，团头鲂为12%，尼罗罗非鱼为14.4%，肉食性鱼类为4~8%。
在我国的鱼用配合饲料中植物蛋白的用量较大，故碳水化合物含量过多的情况比较多见。饲料中碳水化合物含量过高，会引起鱼类糖代谢紊乱，造成内脏的脂肪积累，其病变主要部位是肝脏，大量的肝糖积累和脂肪侵润，造成肝肿大，色泽变淡，外表有光泽，严重的脂肪肝还可引发肝病变，使肝脏失去正常机能，机体衰竭，最后导致死亡。
一般在高碳水化合物饲料中，增加胆碱、肌醇和维生素C的用量，可控制脂肪肝的发展。
三．脂肪含量不足或变质
饲料中所含的脂肪不能被鱼类直接利用，必须在脂肪酶的作用下分解为甘油和脂肪酸后，才能被鱼类吸收。脂肪主要生理作用是为鱼类生命活动提供能源，同时为鱼类提供必需脂肪酸（EFA）。鱼类能充分利用脂肪，不能很好地利用碳水化合物，鱼类常常利用消耗蛋白质的方式补充能源，因此在饲料中添加适量的（低融点）脂肪，提高饲料可消化能的含量，减少鱼类蛋白质的能量消耗，可达到节约蛋白质的效果。
鱼类饲料中的含脂量，因脂肪酸的种类和鱼的品种、年龄、食性、水温的不同而异。一般饲料中添加含高不饱合脂肪酸的鱼油比添加含亚麻酸和亚油酸的植物油的用量更少。根据国外对鳗鲡和虹鳟两种鱼的研究，成鱼在高温季节及产卵前需要量为5%左右，鲤鱼在高温季节为5~10%，低温季节最多5%。一般应用饲料中脂肪的含量在3~18%的范围内。
鱼饲料中应添加低融点脂肪，温血动物的硬化脂不能使用。因这类脂肪的融点高，不易消化，如长期使用这种脂肪，会引发脂肪肝。
脂肪是十分容易氧化的物质，氧化变质的脂肪产生的醛、酮、酸对鱼有毒，鲤鱼摄食变质脂肪饲料，一个月后即可患瘦背病，虹鳟则引起贫血和肝病变。所以应引起足够的注意。通常在饲料中添加足量的维生素E可以防止氧化脂肪对鱼类的毒害。
四．维生素缺乏症
鱼类需要四种脂溶性维生素和十二种水溶性维生素。脂溶性维生素为：维生素A、D、E、K；水溶性维生素为：硫胺素（B1）、核黄素（B2）、吡哆醇（B6）、泛酸、烟酸、生物素（VH）、叶酸（BC）、氰钴胺素（B12）、胆碱、肌醇、抗坏血酸（VC）、对氨基苯甲酸。
鱼类对维生素的需要量因鱼的种类和生长阶段不同而有很大差别。鱼类对维生素缺乏的反应相当慢，也就是说鱼类能够长时间地在完全没有维生素摄入的情况下生存，而且各种鱼类的维生素缺乏症的症状也不完全相同。下面列出了鲤鱼和斑点叉尾两种鱼类的维生素缺乏症的症状。
鲤鱼维生素缺乏症
维生素名称 缺乏症
维生素Ａ
皮肤色浅、眼突出、鳍和皮肤出血、鳃盖变形
维生素Ｄ 未出现异常
维生素Ｅ
眼突出、肌营养不良、脊柱前凸、肾及胰脏退化
维生素Ｋ 未出现异常
硫胺素 易吓惊、皮下出血、肤色浅
核黄素
消瘦、怕光、易惊吓、皮肤及鳍出血、前肾坏死
吡哆醇
贫血、神经失调、肝胰脏转移酶活性下降
泛酸
生长不良、无活力、皮肤出血、眼突出
烟酸 皮肤出血、死亡
生物素 无活力、表皮粘液细胞增加
叶酸 未测出需要量
氰钴胺素 未测出需要量
胆碱 脂肪肝、肝细胞空泡化
肌醇 皮粘膜分泌减少
抗坏血酸 生长不良
斑点叉尾的维生素缺乏症
维生素名称 缺乏症
维生素Ａ
眼突出、浮肿、肾脏出血、肤色变浅。
维生素Ｄ 骨中灰分降低、钾、钙降低。
维生素Ｅ
肤色变浅、肌营养不良、渗出性出血、脂肪肝、胰脏萎缩、蜡质状沉积
维生素Ｋ 皮肤出血。
硫胺素 皮肤发黑、失衡、易惊吓。
核黄酸 体长过短。
吡哆醇
神经失调、痉挛、游动不正常、体蓝绿色。
泛酸 消瘦、表皮损伤、贫血、致死。
烟酸
皮肤及鳍溃疡、颌部变形、突眼症、贫血、致死。
生物素
肤色变浅、过敏、肝中丙酮酸羧化酶减少。
叶酸 不活跃、贫血、易被细菌感染。
氰钴胺素 生长下降、血细胞比容下降。
胆碱 肝增大、肾脏及肠出血。
肌醇 未测出。
抗坏血酸
体内外出血、烂鳍、骨胶原下降、脊柱前凸、侧凸。
注： 上述的主要缺乏症未包括厌食和生长不良，因为这些症状不是唯一可观察到的症状。死亡表示某些维生素缺乏症很严重时，试验鱼迅速死亡。
五．无机盐及微量元素缺乏症
无机盐和微量元素是构成鱼体组织的重要成分，是保持鱼体物质的正常代谢和保证各种组织和器官正常生理功能所不可缺少的营养素。
无机盐也称矿物质，鱼类所需的矿物元素主要有：钾、钠、钙、镁、磷、硫、氯七种常量元素和铁、铜、碘、锰、锌、碘、钴、钼、矽等微量元素。鱼类能吸收水中溶解的的无机盐，但种类为数极少。所以从饲料中补充无机盐作为营养素仍然是必要的，各种鱼类缺乏无机盐及微量元素的缺乏症症状表现十分相似。如下表。
鱼类矿物质元素缺乏症
元素 鱼类表现的缺乏症
磷
食欲不振、生长缓慢、骨骼异常、头部畸形、脊椎弯曲、体贮脂肪量增加、鱼体水分下降、骨骼重量下降
镁
生长下良、死亡率高、游泳状态异常、痉挛、骨骼钙增加、弯曲、肌肉僵直、肾脏结石
锌
生长不良、死亡率高、皮肤及鳍发炎并糜烂、白内瘴
锰 生长不良、运动迟缓
铜 生长不良、低血蛋白状贫血
铁 低色素性小球状贫血
硒 肌骨发育异常、死亡率高
碘
生长不良、甲状腺功能受阻、鳃的下部出现肿块