据2005年有关部门对水禽业的不完全统计，我国为世界水禽第一生产大国，家养水禽总饲养量37亿只，占世界水禽总饲养量的75％以上，鸭年存栏量7.25亿只，占世界鸭存栏量的70％，鹅年存栏量2.68亿只，占全球鹅存栏量的89％；鸭、鹅年屠宰量分别为18.04亿只和5.43亿只，占全球鸭、鹅屠宰总量的75.5%和93.2%。
随着我国饲养水禽品种的增多，水禽饲养密度加大，饲养条件粗放，屠宰交易不规范，水禽漂蛋远距离运输（南方种蛋漂蛋到外省的非常多），免疫水禽的带毒现象、家养水禽与候鸟接触、水灾频繁和水域泛滥等，使水禽疫病的发生越来越严重，特别是近几年来高致病性禽流感的发生和流行以及人感染禽流感病例的出现。
一、我国水禽疫病的防控
（一）水禽的主要疫病
目前我国主要的鸭病 （略）
目前我国主要的鹅病 （略）
（二）水禽疫病的防控
禽流感过去主要对鸡致病，90年末开始对水禽致病，在本世纪对哺乳动物包括人致病，所以笔者认为，水禽疫病的防控，禽流感最有代表性。
1．我国禽流感发生的现状
水禽多发 目前我国防控高致病性禽流感的策略主要依赖疫苗，而现有的禽流感疫苗对水禽的免疫保护效果不如对鸡好。免疫水禽、对禽流感病毒不太敏感品种的水禽、大日龄种鸭（鹅）或蛋鸭存在不同程度的带毒现象，而且家鸭体内的禽流感病毒主要在其肠道复制，肠道中病毒滴度高，所以排泄物污染水体后易造成传播。
零星发生 由于我国从2005年起开始对水禽推荐使用H5N1灭活疫苗，使免疫水禽得到了保护，但仍有未免疫、免疫不确实、免疫程序不当或免疫接种后抗体水平不高的水禽和生长期短的肉鸭（北京鸭、樱桃谷鸭、杂交肉鸭）零星发生禽流感。
先水禽后鸡 尽管过去鸡比鸭更容易感染禽流感，且感染发病后死亡率很高。但近几年来，在鸡、鸭混养或鸡鸭通常分隔饲养的养殖场，出现鸭先发生禽流感后再传给鸡的现象。
多在农村 一些水禽小饲养户，尤其是农村散养户，由于投资少，饲养条件比较粗放，加上多为放养或未经过疫苗免疫或免疫不及时等原因，所以农村饲养的水禽更容易发生禽流感。
野鸟介入 目前世界上公认的侯鸟迁徙路线有8条，经过我国的候鸟迁徙路线为亚洲候鸟迁徙路线的分支，主要有3条，第一条是太平洋迁徙路线，主要经过我国的东南沿海省份；第二条是东亚——澳大利亚迁徙路线，主要经过我国的中部省份；第三条是中亚迁徙路线，主要经过我国青藏高原等西部地区，野鸟的迁徙导致了禽流感病毒的传播。
2．水禽（鸭）流感病毒生态学
水禽（如鸭）流感病毒主要是嗜肠道型，主要在家禽、水禽、野生鸟类及哺乳动物（包括人）之间持续循环。随着水禽品种的增多、饲养密度的加大，陆生家禽（鸡）与水禽（鸭、鹅）混养或同场分隔饲养以及野鸟的迁徙，都造成了禽流感病毒生态学极为复杂。
据报道目前已经从家禽、水禽、野鸟、哺乳动物（猪、老虎、猫、人）和苍蝇身上分离到了禽流感病毒，这里是禽流感病毒巨大的基因库。而且禽流感病毒还可以在飞鸟、鸭、鹅、猪、人、鸡(火鸡)之间单向或双向传播。
3．水禽在禽流感发生中的主要作用
水禽是禽流感病毒的巨大贮存库。目前鸭已成为禽流感病毒易感的自然感染发病、死亡的禽类。这种现象在以前是不存在的，从90年代末期以来这个问题已严重危害我国的禽类，包括水禽。禽流感病毒可横向传染陆生禽类而成为发生禽流感的传染源，所以水禽（如鸭）在陆生家禽禽流感的发生和流行中具有十分重要的流行病学意义，所以笔者认为要控制和消灭禽流感首先要控制和消灭水禽的流感。
4．水禽流感的诊断
农业部颁布的诊断标准有三个，一是临床诊断、二是血清学诊断、三是病原学诊断。
临床诊断 临床诊断的标准是急性发病死亡、有明显的神经症状、严重出血或坏死。病鸭感染禽流感病毒后常呈急性死亡，临床可见角弓反张、仰脖等神经症状。剖检可见病鸭心肌呈白色条纹状坏死（为鸭流感典型的特征性症状），脑膜出血，脑组织坏死，肝脏表面出血，心冠脂肪和心肌出血，肺脏出血，脾脏有出血点或出血斑，腺胃出血并有大量的坏死点。胰腺有大量透明的坏死点、坏死灶（也为鸭流感的特征性病变），肠道外观肿胀、出血，剪开后可见小肠黏膜有明显的出血带。回肠、直肠、盲肠黏膜严重出血。蛋鸭产软壳蛋、薄壳蛋、畸形蛋，卵黄充血、出血。
血清学诊断 只适用于非免疫鸭群，因为无法区别免疫病毒和野毒感染。诊断标准为H5或H7亚型的血凝抑制效价HI>1：16。
病原学诊断 病原学诊断的标准主要有三个：H5或H7亚型病毒分离阳性、H5或H7亚型特异性分子生物学技术（PT-PCR）诊断阳性、任何亚型病毒静脉内接种致病指数（IVPI）大于1.2。
5．水禽流感的防控措施
实行免疫预防 实行免疫预防是禽流感的最后防线，也是关键措施，要做到“乡不漏村，村不漏户，户不漏禽，禽不漏针”，确保我国水禽免疫率达到100％，免疫抗体合格率达到85％以上。
有计划分步骤的防控疫情 针对高致病性禽流感这个特殊疫病，应借鉴国外先进经验，采取不同措施进行综合防控。
加强安全研究平台建设，继续加强水禽流感研究 与发达国家相比，目前我国医学研究条件相对较差，能对高致病性禽流感等一类传染病开展研究的机构屈指可数，从而导致对这类疾病的研究明显滞后，相对技术储备贫乏，迫切需要先进、安全的可从事这一类动物传染病研究的平台。为给水禽的流感防控提供更坚实的技术支持，今后应加强水禽健康养殖技术、水禽流感流行病学、免疫水禽带毒状况监测、活禽市场和水禽带毒状况监测、水禽流感病毒分子流行病学、水禽流感病毒生态学的研究。
推行生物安全饲养模式 改善硬件建设，树立新观念。推行标准化饲养、规范化管理。
加速推行家禽定点屠宰，强化防疫队伍的建设 目前我国家禽还没有启动家禽定点屠宰，应借鉴我国猪定点屠宰的管理经验，并尽快制定活禽交易的必备准则。同时构建省－市－县－乡－村动物防疫体系，加强乡村级兽医人员技术培训等工作，切实强化我国动物疫病防控队伍的建设。
